Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik3B1AS29 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms