Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp36B1AQJ2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms