Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Palm3A2TJV2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palm3A2TJV2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms