Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms