Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syndig1A2ANU3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms