Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Shroom2A2ALU4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Shroom2A2ALU4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shroom2A2ALU4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms