Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Frmpd1A2AKB4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms