Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Brwd3A2AHJ4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brwd3A2AHJ4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms