Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap5A2AGT5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ckap5A2AGT5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms