Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmpd4A2AFR3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms