Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930447F04RikA2AFR2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms