Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a53A2AF28 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms