Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kiaa1109A2AAE1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kiaa1109A2AAE1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms