Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef6A2A8M8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pramef6A2A8M8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Pramef6A2A8M8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pramef6A2A8M8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pramef6A2A8M8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pramef6A2A8M8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pramef6A2A8M8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms