Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprfA2A8L5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprfA2A8L5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms