Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm27029A2A4P4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms