Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd2l1A2A259 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms