Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms