Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms