Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Scn2aA0A0J9YTW6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Scn2aA0A0J9YTW6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Scn2aA0A0J9YTW6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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