Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Trbv30A0A0B4J1P1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv30A0A0B4J1P1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Trbv30A0A0B4J1P1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trbv30A0A0B4J1P1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv30A0A0B4J1P1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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