Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Trbv19A0A0B4J1H4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv19A0A0B4J1H4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv19A0A0B4J1H4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv19A0A0B4J1H4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv19A0A0B4J1H4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv19A0A0B4J1H4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv19A0A0B4J1H4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv19A0A0B4J1H4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Trbv19A0A0B4J1H4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Trbv19A0A0B4J1H4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Trbv19A0A0B4J1H4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Trbv19A0A0B4J1H4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Trbv19A0A0B4J1H4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv19A0A0B4J1H4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trbv19A0A0B4J1H4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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