Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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