Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWX0

Ighv1-19, Immunoglobulin heavy variable V1-19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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