Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trbv31A0A075B5J5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trbv31A0A075B5J5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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