Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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