Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprtQ99M80 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms