Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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