Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Chsy1Q6ZQ11 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Chsy1Q6ZQ11 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Chsy1Q6ZQ11 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chsy1Q6ZQ11 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chsy1Q6ZQ11 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Chsy1Q6ZQ11 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms