Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Rpusd2Q149F1 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Rpusd2Q149F1 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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Rpusd2Q149F1 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms