Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Hoxd9P28357 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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