Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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