Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Gm379J3QQ19 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Gm379J3QQ19 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms