Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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