Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Col5a3Q9JLI2 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Col5a3Q9JLI2 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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