Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Smg9Q9DB90 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Smg9Q9DB90 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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Smg9Q9DB90 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Smg9Q9DB90 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Smg9Q9DB90 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Smg9Q9DB90 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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