Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Apobec3Q99J72 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms