Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms