Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Krt40Q6IFX3 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms