Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms