Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Znf48Q3US17 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Znf48Q3US17 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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