Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sap25Q1EHW4 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Sap25Q1EHW4 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Sap25Q1EHW4 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sap25Q1EHW4 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms