Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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