Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxd13P70217 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Hoxd13P70217 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms