Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms