Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Hoxd10P28359 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms