Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TtrP07309 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TtrP07309 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms