Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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Ccl20O89093 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Ccl20O89093 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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