Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp9yF8VPU6 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms