Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Irx4Q9QY61 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms